Isabelle Lequien débute l’apprentissage de la musique par le violon et le piano et se tourne très vite vers la sonorité chaleureuse de l’alto. Elle obtient en 1985 un 1er prix au CNSM de Paris dans la classe de Colette Lequien. Passionnée de musique de chambre elle intègre le cycle de perfectionnement du CNSM dans la classe de Christian Ivaldi et fonde le quatuor avec piano Fidelio qui remporte le 1er prix "Sergio Lorenzi" au concours international de Trieste (Italie).
Elle partage son activité musicale entre des concerts en soliste ou en musique de chambre au seine plusieurs formations (la Roque d’Anthéron, festivals de Stresa et de Malte, salle Gaveau à Paris, Théâtres de St Quentin en Yvelines, du Rond Point des Champs Elysées à Paris, de la criée à Marseille, week ends de l’Ermitage à La Baule, les Estivales en Puisaye Forterre , etc..).
Elle se tourne vers des expériences théâtrales d’abord dans le trio « Arts d’Echos » (notamment « l’Hypothèse Mozart » pièce-musicale sur un texte de Frédéric Sounac, mise en scène Bernard Bloch à l’affiche la saison 2008-2009) puis seule avec deux monologues : « Madame Marguerite » » de Roberto Athayde et « Le Sas » de Michel Azama, en collaboration avec le compositeur Thierry Machuel mise en scène Karine Kadi, qu’elle joue au CRR de Boulogne Billancourt en 2017.
Elle devient l’altiste de l’Ensemble Hélios (flûte et trio à cordes) qui diversifie ses activités ; théatre musical ( notamment spectacle « J’suis différent » ayant obtenu le prix de l’initiative laïque de la MAIF, MGEN, CASDEN en 2022) concerts plus traditionnels avec un souci de recherche d’oeuvres et compositeurs oubliés ou méconnus, commandes et création ( l’ensemble ayant à son catalogue plus d’une centaine d’oeuvres contemporaines dédiées )
Très attirée par la pédagogie, elle obtient le CA d’alto en 1995. Elle enseigne au CRR de Boulogne-Billancourt depuis 1987. Elle rejoint Michel Michalakakos, Gérard Caussé et Antoine Tamestit pour enseigner au CNSM de Paris pendant une dizaine d’années.